Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MLH1P40692 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms