Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC13P31276 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXC13P31276 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms