Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
PLNP26678 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
PLNP26678 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PLNP26678 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
PLNP26678 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
PLNP26678 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms