Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DPA1P20036 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms