Protein–RNA interactions for Protein: P19075

TSPAN8, Tetraspanin-8, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN8P19075 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSPAN8P19075 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms