Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GCATO75600 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GCATO75600 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GCATO75600 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms