Protein–RNA interactions for Protein: O43586

PSTPIP1, Proline-serine-threonine phosphatase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSTPIP1O43586 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSTPIP1O43586 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms