Protein–RNA interactions for Protein: C9JVG2

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9JVG2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C9JVG2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C9JVG2 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C9JVG2 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9JVG2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms