Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC78A2IDD5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC78A2IDD5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms