Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CTSFQ9UBX1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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