Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
COPS7AQ9UBW8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
COPS7AQ9UBW8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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