Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SCHIP1Q9P0W5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCHIP1Q9P0W5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms