Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SEMA4BQ9NPR2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms