Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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RAB9BQ9NP90 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RAB9BQ9NP90 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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