Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYP4F12Q9HCS2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms