Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLHL4Q9C0H6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL4Q9C0H6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms