Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ROPN1BQ9BZX4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ROPN1BQ9BZX4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms