Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GATA5Q9BWX5 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms