Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MCMBPQ9BTE3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms