Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPAS2Q99743 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPAS2Q99743 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms