Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SDCCAG3Q96C92 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SDCCAG3Q96C92 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms