Protein–RNA interactions for Protein: Q92764

KRT35, Keratin, type I cuticular Ha5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT35Q92764 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KRT35Q92764 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms