Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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SEMA6DQ8NFY4 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SEMA6DQ8NFY4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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