Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF548Q8NEK5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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