Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VWA5B2Q8N398 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms