Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LMNTD2Q8IXW0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms