Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D4Q7Z3S7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D4Q7Z3S7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms