Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q7L0L9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q7L0L9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q7L0L9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Q7L0L9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Q7L0L9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Q7L0L9 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms