Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
UBAP2Q5T6F2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms