Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDLIM3Q53GG5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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