Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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SP6Q3SY56 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SP6Q3SY56 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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