Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC96Q2M329 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC96Q2M329 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms