Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
IMPG1Q17R60 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms