Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Length 200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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CDO1Q16878 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDO1Q16878 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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