Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SKIV2LQ15477 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SKIV2LQ15477 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms