Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIX1Q15475 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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SIX1Q15475 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SIX1Q15475 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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