Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ARL17B-207ENST00000575960 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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RYR3Q15413 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 MIR611-201ENST00000384869 67 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
RYR3Q15413 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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