Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PDCD1Q15116 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms