Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GTF2H3Q13889 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GTF2H3Q13889 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms