Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RLFQ13129 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RLFQ13129 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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