Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
APOBRQ0VD83 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms