Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GBE1Q04446 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GBE1Q04446 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms