Protein–RNA interactions for Protein: P55347

PKNOX1, Homeobox protein PKNOX1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1P55347 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PKNOX1P55347 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms