Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CNGA1P29973 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CNGA1P29973 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms