Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VARSP26640 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VARSP26640 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VARSP26640 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms