Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSMA3P25788 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms