Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
XPAP23025 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
XPAP23025 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
XPAP23025 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms