Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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CXCL3P19876 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CXCL3P19876 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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