Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CTLA4P16410 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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