Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFD1P11586 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MTHFD1P11586 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms